یکی از موارد مهم و اساسی در تصمیم گیری سازندگان سردخانه، قیمت تجهیزات و هزینه ساخت سردخانه می‌باشد. هزینه های سردخانه را می‌توان به دو گروه سرمایه گذاری و هزینه های جاری تقسیم کرد. گروه سرمایه‌گذاری مربوط به هزینه هایی است که به احداث سردخانه مربوط می‌باشند مانند هزینه زمین، محوطه‌سازی، ساختمان‌سازی، تاسیسات و تجهیزات عمومی، ماشین آلات، وسایل نقلیه و تجهیزات اداری و کارگاهی. هزینه‌های جاری نیز مربوط به بهره برداری از سردخانه می‌باشند. در ادامه، هزینه های عمده معرفی می‌شوند.